О чем «рассказали» митохондрии неандертальцев?

Сначала ученые смогли проанализировать только ДНК митохондрий у неандертальцев, потому что митохондрий в каждой клетке много и можно получить больше материала для анализа из древнего образца. На основе сравнения митохондриальной ДНК неандертальцев и современного человека был сделан вывод, что неандертальцы и современные люди — родственники, но довольно далекие. Результаты анализа позволяли предположить, что скрещиваний между неандертальцами и человеком разумным не происходило. Спустя несколько лет, после усовершенствования методов анализа ДНК из древних образцов и обнаружения хорошо сохранившихся костей неандертальцев, удалось проанализировать ядерную ДНК неандертальцев. Оказалось, что у европейцев приблизительно 2,5% генома неандертальского происхождения. Это значило, что неандертальцы и люди современного типа скрещивались в период, когда их пути пересеклись. Предположительно это произошло между 40 и 75 тысяч лет назад.

Таким образом, есть два результата с (казалось бы) противоположными выводами. Этот конфликт результатов можно объяснить особенностями наследования митохондриальной ДНК. Она передаётся от матери детям. То есть в гибридизации между неандертальцами и современными людьми участвовали лишь неандертальцы-мужчины, либо не сохранилось ни одного человека, который бы имел неандертальца-женщину в качестве прямого предка по материнской линии. Кроме геномных данных есть и другие доказательства скрещиваний между неандертальцами и людьми современного типа. Так, анализ ДНК челюстной кости возрастом 40 000 лет показал, что мужчина, которому принадлежала этот кость, имел предка-неандертальца 4-6 поколений назад. Не только неандертальцы, но также и денисовцы оставили след в геноме современных людей, но только в геноме жителей островов Меланезии (4–6% генома), и в меньшей степени других популяций тихоокеанских островов и некоторых жителей Восточной Азии.