Знаете ли вы, откуда получают древнюю ДНК?
Чаще всего древнюю ДНК получают из зубов или костей. Для извлечения ДНК редкие образцы приходится разрушать до порошкообразного состояния, поэтому дальнейшее их изучение становится невозможным. Кроме этого, большинство древних видов и популяций плохо представлены в ископаемых останках или даже отсутствуют в них. Поэтому исследователи ищут альтернативные источники древней ДНК.
Недавно международной команде ученых
удалось получить древнюю ДНК из отложений пещеры Чикиуит на севере Мексики. Исследователи взяли образцы отложений на разных уровнях дна пещеры, извлекли ДНК из 48 из них и секвенировали всю ДНК в каждом образце, получив так называемую ДНК окружающей среды. Эти образцы содержали сумму фрагментов ДНК из сброшенных клеток, волос, фекалий и мочи, сохраненных в осадке. В этой суммарной ДНК им удалось обнаружить геномы двух видов медведей: предка современных американских черных медведей и гигантского короткомордого медведя, вымершего вида, наиболее известного по окаменелостям в Канаде. Это удалось сделать с помощью сравнения проанализированной ДНК с уже известными последовательностями в базах данных. То есть метод получения ДНК из окружающей среды подходит для обнаружения уже известных древних организмов, например, для выявления мест обитания и миграции древних животных.